جایگاه، ارزش و اعتبار هر کتابخانه علاوه بر موقعیت جغرافیایی و تعداد و نوع آثار و منابع به روز و جاری آن، به مجموعه‌های منحصربه فرد و خاص آن نیز بستگی مستقیم دارد. کتابخانه آیتالله العظمی بروجردی یکی از کتابخانه‌‌های غنی سطح کشور در این زمینه بشمار می‌آید که از لحاظ موضوع، تعداد و تنوع منابع، دارای اهمیت زیادی است و این امر موجب گردیده تا مورد توجه و مراجعه پژوهشگران قرار گیرد.
به منظور دسترسی‌پذیری آسان و سریع پژوهشگران به این منابع، کتابخانه بر آن شد تا فهارس مجموعه‌های منحصربه‌فرد و خاص خود را به صورت فایل اکسل و پی دی اف، در پایگاه اطلاع رسانی کتابخانه، برای استفاده پژوهشگران، ارائه نماید.
این مجموعه ها شامل: نسخ خطی، چاپهای سنگی، منابع چاپی کهن و نادر، پایان‌نامه‌‌ها، کتب درسی قدیمی، کتابهای لاتین، مطبوعات و نشریات، اسناد، کاتالوگ‌ها، منابع دیداری-شنیداری، آیین‌نامه‌ها و اساسنامه‌ها، کتابهای نظامی قدیمی و کتابشناسی آیتالله العظمی بروجردی است. هر بخش از این مجموعه‌ها خود حاوی آثار و منابع بسیار فاخر، نفیس و در برخی موارد، از لحاظ قدمت و موضوع منحصربه فردی است که می‌تواند در مطرح نمودن این مجموعه ها تاثیر بسزایی داشته باشد.
این مجموعه‌ها طی سالهای طولانی از زمان تاسیس این کتابخانه تا به امروز، از طرق مختلف و توسط آیات عظام: حضرت آیت الله العظمی بروجردی و آیت الله مقدس اصفهانی و آیت الله فرید اراکی و در ادامه توسط واقفین بزرگی همچون حاج محمد رمضانی گردآوری شده که هر یک به نوبه خود، بر وزن و اعتبار این مجموعه افزوده است.
تمامی منابع و آثار موجود در این مجموعه ها، دیجیتال سازی شده و تصاویر آنها از طریق پایگاه اطلاع‌رسانی کتابخانه، در بخش کتابخانه دیجیتالی در دسترس پژوهشگران قرار گرفته است. در مورد هر یک از این مجموعه‌ها در جایگاه خود به تفصیل توضیح داده خواهد شد.