آیت الله اعرافی چهارشنبه شب در پنجمین نشست هم اندیشی مدیران واحدهای پژوهشی حوزه که در کتابخانه آیت الله العظمی بروجردی(ره) برگزار شد، با اشاره به خدمات علمی آیت الله العظمی بروجردی و حقی که ایشان بر حوزویان دارد گفت: همیشه باید در هر حال از این بزرگان و این علمای ربانی نام برد و به خصوص باید از امام و شهدا یاد کنیم که این مسیر نورانی را پیش روی ما قراردادند. وی افزود: همه فعالیت هایی که در حوزه انجام می شود، گرامی و گرانسنگ است و موسسات پژوهشی بسیاری در حوزه  فعالیت های فاخر انجام می دهند؛ مراکزی در قم حضور دارند که در عرصه های پژوهشی خاص فعالیت می کنند که باید از همه آنها تقدیر کرد. آیت الله اعرافی بیان کرد: حوزه های علمیه گام های بزرگی در زمینه تحقیق برداشته اند و هم اینکه در عرصه بازپروری و تولید دانش معارف اسلامی تجلیات خوبی در حوًزه ما قابل مشاهده است وی گفت: نفس پژوهش، همان دست یابی به حق و عرضه درست واقعیت ها برای رسیدن بشر به سعادت است که این مساله از اهمیت خاصی برخورد است و مسئولیت این جریان نیز بسیار مهم است؛ زمانی که این عینک حقیقت یابی و عرضه حقیقت متوجه به مفاهیم دینی می گردد، این مسئولیت دو چندان می شود؛ هر تحقیق و پژوهش دینی باید با روش شناسی درست انجام شود. آیت الله اعرافی خاطرنشان کرد: مراکز علمی پژوهشی و تخصصی و فناوری های تحقیقاتی و توسعه کتابخانه ها و پایه ریزی مجلات و اعطای بودجه های پژوهشی و ایجاد چاپخانه ها، سایت ها و.. از جمله فعالیت هایی بوده که در  درون جامعه حوزوی شکل گرفته است. عضو شورای عالی انقلاب فرهنگی تصریح کرد: ذات درس های خارج، پژوهش است؛ 600 درس خارج در حوزه وجود دارد که در زمینه علوم عقلی و تفسیر و.... در سطوح عالی ارایه می شود؛ حجم تولیدات کتاب ها و نرم افزارها و موسوعه ها و شکل گیری انجمن های علمی و گروه ها و اساتید حوزه از جمله حرکت های حوزه در این عرصه است ؛ در قم 3 تا 4هزار استاد حضور دارند که فعالیت های فاخر پژوهشی و علمی را در این شهر انجام می دهند. آیت الله اعرافی خاطرنشان کرد: اصولا جای یک چشم انداز و نقشه جامع و نظام جامعی که راهنمای حرکت پژوهشی باشد انجام نشده است که البته این پروژه بزرگ در قالب های مختلف در دست پیگیری است؛ همچنین در عرصه هماهنگی ها نیز ضعف هایی وجود دارد که باید پوشش دهد؛ در این زمینه باید یک طرح جامع ایجاد شود که مجموعه این کارها بتواند یک هماهنگی لازم را ایجاد کند.